Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQT9

CLSTN3, Calsyntenin-3, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3Q9BQT9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLSTN3Q9BQT9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLSTN3Q9BQT9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms