Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ39

DDX50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX50Q9BQ39 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX50Q9BQ39 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX50Q9BQ39 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms