Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPAS2Q99743 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms