Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCL13Q99616 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCL13Q99616 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCL13Q99616 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCL13Q99616 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCL13Q99616 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCL13Q99616 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCL13Q99616 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCL13Q99616 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCL13Q99616 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCL13Q99616 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCL13Q99616 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCL13Q99616 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCL13Q99616 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms