Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUFY1Q96T51 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms