Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ3

MCCC1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC1Q96RQ3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCCC1Q96RQ3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCCC1Q96RQ3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCCC1Q96RQ3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCCC1Q96RQ3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCCC1Q96RQ3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCCC1Q96RQ3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCCC1Q96RQ3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms