Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ6

FERD3L, Fer3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FERD3LQ96RJ6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FERD3LQ96RJ6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
FERD3LQ96RJ6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FERD3LQ96RJ6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FERD3LQ96RJ6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FERD3LQ96RJ6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FERD3LQ96RJ6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FERD3LQ96RJ6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FERD3LQ96RJ6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FERD3LQ96RJ6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FERD3LQ96RJ6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FERD3LQ96RJ6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FERD3LQ96RJ6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FERD3LQ96RJ6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FERD3LQ96RJ6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FERD3LQ96RJ6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FERD3LQ96RJ6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FERD3LQ96RJ6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FERD3LQ96RJ6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FERD3LQ96RJ6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FERD3LQ96RJ6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FERD3LQ96RJ6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FERD3LQ96RJ6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FERD3LQ96RJ6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FERD3LQ96RJ6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FERD3LQ96RJ6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FERD3LQ96RJ6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FERD3LQ96RJ6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FERD3LQ96RJ6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FERD3LQ96RJ6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FERD3LQ96RJ6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FERD3LQ96RJ6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FERD3LQ96RJ6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FERD3LQ96RJ6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FERD3LQ96RJ6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FERD3LQ96RJ6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FERD3LQ96RJ6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FERD3LQ96RJ6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms