Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q40

CDK15, Cyclin-dependent kinase 15, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK15Q96Q40 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDK15Q96Q40 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK15Q96Q40 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK15Q96Q40 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK15Q96Q40 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK15Q96Q40 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK15Q96Q40 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK15Q96Q40 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK15Q96Q40 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK15Q96Q40 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK15Q96Q40 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK15Q96Q40 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK15Q96Q40 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK15Q96Q40 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK15Q96Q40 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK15Q96Q40 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK15Q96Q40 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK15Q96Q40 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK15Q96Q40 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK15Q96Q40 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK15Q96Q40 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK15Q96Q40 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK15Q96Q40 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK15Q96Q40 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK15Q96Q40 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK15Q96Q40 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK15Q96Q40 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK15Q96Q40 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK15Q96Q40 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK15Q96Q40 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK15Q96Q40 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK15Q96Q40 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK15Q96Q40 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK15Q96Q40 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK15Q96Q40 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK15Q96Q40 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK15Q96Q40 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK15Q96Q40 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK15Q96Q40 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK15Q96Q40 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK15Q96Q40 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK15Q96Q40 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms