Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG7

NSMCE3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE3Q96MG7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NSMCE3Q96MG7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms