Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB3

IFT74, Intraflagellar transport protein 74 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT74Q96LB3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT74Q96LB3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT74Q96LB3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT74Q96LB3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT74Q96LB3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT74Q96LB3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT74Q96LB3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT74Q96LB3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT74Q96LB3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT74Q96LB3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT74Q96LB3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT74Q96LB3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT74Q96LB3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT74Q96LB3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT74Q96LB3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT74Q96LB3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT74Q96LB3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT74Q96LB3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT74Q96LB3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT74Q96LB3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT74Q96LB3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT74Q96LB3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT74Q96LB3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT74Q96LB3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT74Q96LB3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
IFT74Q96LB3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFT74Q96LB3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT74Q96LB3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms