Protein–RNA interactions for Protein: Q96L34

MARK4, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK4Q96L34 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MARK4Q96L34 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MARK4Q96L34 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MARK4Q96L34 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MARK4Q96L34 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MARK4Q96L34 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MARK4Q96L34 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MARK4Q96L34 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MARK4Q96L34 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MARK4Q96L34 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MARK4Q96L34 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms