Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK5RAP3Q96JB5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK5RAP3Q96JB5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms