Protein–RNA interactions for Protein: Q96H20

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNF8Q96H20 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SNF8Q96H20 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNF8Q96H20 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms