Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EDC3Q96F86 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EDC3Q96F86 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EDC3Q96F86 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EDC3Q96F86 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EDC3Q96F86 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EDC3Q96F86 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EDC3Q96F86 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EDC3Q96F86 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EDC3Q96F86 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EDC3Q96F86 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EDC3Q96F86 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EDC3Q96F86 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EDC3Q96F86 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EDC3Q96F86 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EDC3Q96F86 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EDC3Q96F86 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EDC3Q96F86 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EDC3Q96F86 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EDC3Q96F86 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EDC3Q96F86 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EDC3Q96F86 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EDC3Q96F86 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EDC3Q96F86 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
EDC3Q96F86 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EDC3Q96F86 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EDC3Q96F86 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EDC3Q96F86 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EDC3Q96F86 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EDC3Q96F86 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EDC3Q96F86 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EDC3Q96F86 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EDC3Q96F86 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EDC3Q96F86 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EDC3Q96F86 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EDC3Q96F86 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EDC3Q96F86 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EDC3Q96F86 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms