Protein–RNA interactions for Protein: Q96EK2

PHF21B, PHD finger protein 21B, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21BQ96EK2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHF21BQ96EK2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF21BQ96EK2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF21BQ96EK2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF21BQ96EK2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF21BQ96EK2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF21BQ96EK2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF21BQ96EK2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF21BQ96EK2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF21BQ96EK2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF21BQ96EK2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF21BQ96EK2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF21BQ96EK2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF21BQ96EK2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF21BQ96EK2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF21BQ96EK2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF21BQ96EK2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF21BQ96EK2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF21BQ96EK2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF21BQ96EK2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF21BQ96EK2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF21BQ96EK2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF21BQ96EK2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF21BQ96EK2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF21BQ96EK2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF21BQ96EK2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF21BQ96EK2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF21BQ96EK2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF21BQ96EK2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF21BQ96EK2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF21BQ96EK2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF21BQ96EK2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF21BQ96EK2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF21BQ96EK2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF21BQ96EK2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.1 ms