Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NKD1Q969G9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKD1Q969G9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NKD1Q969G9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NKD1Q969G9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NKD1Q969G9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NKD1Q969G9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NKD1Q969G9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NKD1Q969G9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NKD1Q969G9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NKD1Q969G9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NKD1Q969G9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NKD1Q969G9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NKD1Q969G9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NKD1Q969G9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NKD1Q969G9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NKD1Q969G9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NKD1Q969G9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NKD1Q969G9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NKD1Q969G9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NKD1Q969G9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NKD1Q969G9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NKD1Q969G9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NKD1Q969G9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NKD1Q969G9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms