Protein–RNA interactions for Protein: Q92581

SLC9A6, Sodium/hydrogen exchanger 6, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A6Q92581 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9A6Q92581 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9A6Q92581 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9A6Q92581 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9A6Q92581 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9A6Q92581 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9A6Q92581 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9A6Q92581 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9A6Q92581 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9A6Q92581 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9A6Q92581 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC9A6Q92581 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC9A6Q92581 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC9A6Q92581 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC9A6Q92581 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC9A6Q92581 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC9A6Q92581 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC9A6Q92581 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC9A6Q92581 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC9A6Q92581 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC9A6Q92581 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC9A6Q92581 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC9A6Q92581 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC9A6Q92581 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms