Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUW1

BRK1, Protein BRICK1, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRK1Q8WUW1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms