Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACBD4Q8NC06 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACBD4Q8NC06 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms