Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG16L2Q8NAA4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG16L2Q8NAA4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG16L2Q8NAA4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG16L2Q8NAA4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG16L2Q8NAA4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG16L2Q8NAA4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG16L2Q8NAA4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG16L2Q8NAA4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG16L2Q8NAA4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG16L2Q8NAA4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG16L2Q8NAA4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG16L2Q8NAA4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG16L2Q8NAA4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG16L2Q8NAA4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG16L2Q8NAA4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG16L2Q8NAA4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG16L2Q8NAA4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG16L2Q8NAA4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG16L2Q8NAA4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG16L2Q8NAA4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG16L2Q8NAA4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG16L2Q8NAA4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG16L2Q8NAA4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG16L2Q8NAA4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG16L2Q8NAA4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG16L2Q8NAA4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG16L2Q8NAA4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG16L2Q8NAA4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG16L2Q8NAA4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG16L2Q8NAA4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG16L2Q8NAA4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG16L2Q8NAA4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG16L2Q8NAA4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG16L2Q8NAA4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG16L2Q8NAA4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG16L2Q8NAA4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG16L2Q8NAA4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG16L2Q8NAA4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG16L2Q8NAA4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG16L2Q8NAA4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG16L2Q8NAA4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG16L2Q8NAA4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG16L2Q8NAA4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG16L2Q8NAA4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG16L2Q8NAA4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG16L2Q8NAA4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG16L2Q8NAA4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG16L2Q8NAA4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATG16L2Q8NAA4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG16L2Q8NAA4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms