Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV35

WDR49, WD repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR49Q8IV35 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR49Q8IV35 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR49Q8IV35 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR49Q8IV35 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR49Q8IV35 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR49Q8IV35 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR49Q8IV35 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR49Q8IV35 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR49Q8IV35 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR49Q8IV35 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR49Q8IV35 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR49Q8IV35 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR49Q8IV35 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR49Q8IV35 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR49Q8IV35 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR49Q8IV35 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR49Q8IV35 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR49Q8IV35 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
WDR49Q8IV35 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
WDR49Q8IV35 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR49Q8IV35 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
WDR49Q8IV35 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
WDR49Q8IV35 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR49Q8IV35 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR49Q8IV35 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR49Q8IV35 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR49Q8IV35 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR49Q8IV35 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR49Q8IV35 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR49Q8IV35 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR49Q8IV35 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR49Q8IV35 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR49Q8IV35 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR49Q8IV35 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR49Q8IV35 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR49Q8IV35 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR49Q8IV35 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR49Q8IV35 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR49Q8IV35 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR49Q8IV35 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR49Q8IV35 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR49Q8IV35 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms