Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIBP1Q86W92 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIBP1Q86W92 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIBP1Q86W92 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIBP1Q86W92 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIBP1Q86W92 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIBP1Q86W92 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIBP1Q86W92 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIBP1Q86W92 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIBP1Q86W92 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIBP1Q86W92 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIBP1Q86W92 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIBP1Q86W92 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIBP1Q86W92 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPFIBP1Q86W92 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPFIBP1Q86W92 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPFIBP1Q86W92 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPFIBP1Q86W92 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPFIBP1Q86W92 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPFIBP1Q86W92 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPFIBP1Q86W92 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPFIBP1Q86W92 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPFIBP1Q86W92 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPFIBP1Q86W92 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPFIBP1Q86W92 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPFIBP1Q86W92 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPFIBP1Q86W92 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PPFIBP1Q86W92 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PPFIBP1Q86W92 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPFIBP1Q86W92 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPFIBP1Q86W92 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PPFIBP1Q86W92 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PPFIBP1Q86W92 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms