Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNMB4Q86W47 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNMB4Q86W47 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNMB4Q86W47 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNMB4Q86W47 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNMB4Q86W47 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNMB4Q86W47 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNMB4Q86W47 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNMB4Q86W47 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNMB4Q86W47 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNMB4Q86W47 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNMB4Q86W47 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNMB4Q86W47 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNMB4Q86W47 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNMB4Q86W47 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNMB4Q86W47 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNMB4Q86W47 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNMB4Q86W47 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNMB4Q86W47 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNMB4Q86W47 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNMB4Q86W47 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNMB4Q86W47 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNMB4Q86W47 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNMB4Q86W47 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNMB4Q86W47 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNMB4Q86W47 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNMB4Q86W47 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNMB4Q86W47 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCNMB4Q86W47 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCNMB4Q86W47 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCNMB4Q86W47 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms