Protein–RNA interactions for Protein: Q86UB9

TMEM135, Transmembrane protein 135, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM135Q86UB9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM135Q86UB9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM135Q86UB9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM135Q86UB9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM135Q86UB9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM135Q86UB9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM135Q86UB9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM135Q86UB9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM135Q86UB9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM135Q86UB9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM135Q86UB9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM135Q86UB9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM135Q86UB9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM135Q86UB9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM135Q86UB9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM135Q86UB9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM135Q86UB9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM135Q86UB9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM135Q86UB9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM135Q86UB9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM135Q86UB9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM135Q86UB9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM135Q86UB9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM135Q86UB9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM135Q86UB9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM135Q86UB9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM135Q86UB9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM135Q86UB9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM135Q86UB9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM135Q86UB9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM135Q86UB9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM135Q86UB9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM135Q86UB9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM135Q86UB9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM135Q86UB9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM135Q86UB9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM135Q86UB9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM135Q86UB9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM135Q86UB9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM135Q86UB9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM135Q86UB9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM135Q86UB9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM135Q86UB9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM135Q86UB9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM135Q86UB9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms