Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP50Q70EL3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP50Q70EL3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP50Q70EL3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP50Q70EL3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
USP50Q70EL3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP50Q70EL3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms