Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
FGD6Q6ZV73 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
FGD6Q6ZV73 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
FGD6Q6ZV73 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
FGD6Q6ZV73 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
FGD6Q6ZV73 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
FGD6Q6ZV73 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
FGD6Q6ZV73 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
FGD6Q6ZV73 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
FGD6Q6ZV73 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
FGD6Q6ZV73 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
FGD6Q6ZV73 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
FGD6Q6ZV73 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
FGD6Q6ZV73 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
FGD6Q6ZV73 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
FGD6Q6ZV73 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
FGD6Q6ZV73 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
FGD6Q6ZV73 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
FGD6Q6ZV73 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
FGD6Q6ZV73 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
FGD6Q6ZV73 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
FGD6Q6ZV73 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
FGD6Q6ZV73 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
FGD6Q6ZV73 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
FGD6Q6ZV73 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
FGD6Q6ZV73 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC34.47■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
FGD6Q6ZV73 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
FGD6Q6ZV73 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
FGD6Q6ZV73 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
FGD6Q6ZV73 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
FGD6Q6ZV73 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
FGD6Q6ZV73 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
FGD6Q6ZV73 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
FGD6Q6ZV73 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
FGD6Q6ZV73 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
FGD6Q6ZV73 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
FGD6Q6ZV73 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
FGD6Q6ZV73 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
FGD6Q6ZV73 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
FGD6Q6ZV73 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
FGD6Q6ZV73 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
FGD6Q6ZV73 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
FGD6Q6ZV73 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
FGD6Q6ZV73 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
FGD6Q6ZV73 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
FGD6Q6ZV73 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
FGD6Q6ZV73 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
FGD6Q6ZV73 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
FGD6Q6ZV73 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms