Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM47EQ6ZV65 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms