Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SRCAPQ6ZRS2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SRCAPQ6ZRS2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SRCAPQ6ZRS2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SRCAPQ6ZRS2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SRCAPQ6ZRS2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SRCAPQ6ZRS2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SRCAPQ6ZRS2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SRCAPQ6ZRS2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SRCAPQ6ZRS2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SRCAPQ6ZRS2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SRCAPQ6ZRS2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SRCAPQ6ZRS2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SRCAPQ6ZRS2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SRCAPQ6ZRS2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SRCAPQ6ZRS2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SRCAPQ6ZRS2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SRCAPQ6ZRS2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SRCAPQ6ZRS2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SRCAPQ6ZRS2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SRCAPQ6ZRS2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SRCAPQ6ZRS2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SRCAPQ6ZRS2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SRCAPQ6ZRS2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SRCAPQ6ZRS2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SRCAPQ6ZRS2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SRCAPQ6ZRS2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SRCAPQ6ZRS2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SRCAPQ6ZRS2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SRCAPQ6ZRS2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SRCAPQ6ZRS2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SRCAPQ6ZRS2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SRCAPQ6ZRS2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SRCAPQ6ZRS2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SRCAPQ6ZRS2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SRCAPQ6ZRS2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SRCAPQ6ZRS2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SRCAPQ6ZRS2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SRCAPQ6ZRS2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SRCAPQ6ZRS2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SRCAPQ6ZRS2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SRCAPQ6ZRS2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SRCAPQ6ZRS2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SRCAPQ6ZRS2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SRCAPQ6ZRS2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SRCAPQ6ZRS2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SRCAPQ6ZRS2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SRCAPQ6ZRS2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SRCAPQ6ZRS2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SRCAPQ6ZRS2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SRCAPQ6ZRS2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SRCAPQ6ZRS2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SRCAPQ6ZRS2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SRCAPQ6ZRS2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SRCAPQ6ZRS2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SRCAPQ6ZRS2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SRCAPQ6ZRS2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SRCAPQ6ZRS2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SRCAPQ6ZRS2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SRCAPQ6ZRS2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SRCAPQ6ZRS2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SRCAPQ6ZRS2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SRCAPQ6ZRS2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SRCAPQ6ZRS2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SRCAPQ6ZRS2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SRCAPQ6ZRS2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SRCAPQ6ZRS2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SRCAPQ6ZRS2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SRCAPQ6ZRS2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SRCAPQ6ZRS2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SRCAPQ6ZRS2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SRCAPQ6ZRS2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SRCAPQ6ZRS2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SRCAPQ6ZRS2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SRCAPQ6ZRS2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SRCAPQ6ZRS2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SRCAPQ6ZRS2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SRCAPQ6ZRS2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SRCAPQ6ZRS2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SRCAPQ6ZRS2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SRCAPQ6ZRS2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SRCAPQ6ZRS2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
SRCAPQ6ZRS2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SRCAPQ6ZRS2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SRCAPQ6ZRS2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms