Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms