Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATRAIDQ6UW56 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATRAIDQ6UW56 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms