Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F7

LRRC8B, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8BQ6P9F7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC8BQ6P9F7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC8BQ6P9F7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC8BQ6P9F7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC8BQ6P9F7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC8BQ6P9F7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC8BQ6P9F7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC8BQ6P9F7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC8BQ6P9F7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC8BQ6P9F7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC8BQ6P9F7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC8BQ6P9F7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC8BQ6P9F7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC8BQ6P9F7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC8BQ6P9F7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC8BQ6P9F7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC8BQ6P9F7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC8BQ6P9F7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC8BQ6P9F7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC8BQ6P9F7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC8BQ6P9F7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC8BQ6P9F7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC8BQ6P9F7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC8BQ6P9F7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC8BQ6P9F7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC8BQ6P9F7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC8BQ6P9F7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC8BQ6P9F7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC8BQ6P9F7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms