Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZZ7

CAPN13, Calpain-13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN13Q6MZZ7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAPN13Q6MZZ7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms