Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTJ3

KLHDC7A, Kelch domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC7AQ5VTJ3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHDC7AQ5VTJ3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms