Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SAMD5Q5TGI4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms