Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQS7

SH2D4B, SH2 domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4BQ5SQS7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2D4BQ5SQS7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms