Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HERC4Q5GLZ8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms