Protein–RNA interactions for Protein: Q53T94

TAF1B, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1BQ53T94 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1BQ53T94 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms