Protein–RNA interactions for Protein: Q53GA4

PHLDA2, Pleckstrin homology-like domain family A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA2Q53GA4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PHLDA2Q53GA4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PHLDA2Q53GA4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PHLDA2Q53GA4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PHLDA2Q53GA4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PHLDA2Q53GA4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PHLDA2Q53GA4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PHLDA2Q53GA4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PHLDA2Q53GA4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PHLDA2Q53GA4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PHLDA2Q53GA4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PHLDA2Q53GA4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PHLDA2Q53GA4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PHLDA2Q53GA4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PHLDA2Q53GA4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms