Protein–RNA interactions for Protein: Q502W6

VWA3B, von Willebrand factor A domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3BQ502W6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms