Protein–RNA interactions for Protein: Q496A3

SPATS1, Spermatogenesis-associated serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATS1Q496A3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPATS1Q496A3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPATS1Q496A3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPATS1Q496A3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPATS1Q496A3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPATS1Q496A3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPATS1Q496A3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPATS1Q496A3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPATS1Q496A3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPATS1Q496A3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPATS1Q496A3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPATS1Q496A3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPATS1Q496A3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPATS1Q496A3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPATS1Q496A3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPATS1Q496A3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPATS1Q496A3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SPATS1Q496A3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPATS1Q496A3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPATS1Q496A3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPATS1Q496A3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPATS1Q496A3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPATS1Q496A3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPATS1Q496A3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPATS1Q496A3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPATS1Q496A3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SPATS1Q496A3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPATS1Q496A3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPATS1Q496A3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPATS1Q496A3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPATS1Q496A3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPATS1Q496A3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPATS1Q496A3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SPATS1Q496A3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPATS1Q496A3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SPATS1Q496A3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPATS1Q496A3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPATS1Q496A3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPATS1Q496A3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPATS1Q496A3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPATS1Q496A3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPATS1Q496A3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPATS1Q496A3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPATS1Q496A3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms