Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIR4

TMEM30B, Cell cycle control protein 50B, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30BQ3MIR4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms