Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
P3H1Q32P28 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.1 ms