Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q1T7F1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q1T7F1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q1T7F1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q1T7F1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q1T7F1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q1T7F1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q1T7F1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q1T7F1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q1T7F1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q1T7F1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q1T7F1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q1T7F1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q1T7F1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q1T7F1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q1T7F1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q1T7F1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q1T7F1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q1T7F1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q1T7F1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q1T7F1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q1T7F1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q1T7F1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q1T7F1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q1T7F1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q1T7F1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q1T7F1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q1T7F1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q1T7F1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q1T7F1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q1T7F1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q1T7F1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q1T7F1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q1T7F1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q1T7F1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q1T7F1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q1T7F1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q1T7F1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q1T7F1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q1T7F1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q1T7F1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q1T7F1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q1T7F1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q1T7F1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q1T7F1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q1T7F1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q1T7F1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q1T7F1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q1T7F1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q1T7F1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q1T7F1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q1T7F1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q1T7F1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q1T7F1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q1T7F1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q1T7F1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q1T7F1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q1T7F1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q1T7F1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q1T7F1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q1T7F1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q1T7F1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q1T7F1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q1T7F1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q1T7F1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q1T7F1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q1T7F1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q1T7F1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q1T7F1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q1T7F1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q1T7F1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q1T7F1 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q1T7F1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q1T7F1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q1T7F1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q1T7F1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q1T7F1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q1T7F1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q1T7F1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q1T7F1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q1T7F1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q1T7F1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q1T7F1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q1T7F1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q1T7F1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q1T7F1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q1T7F1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q1T7F1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q1T7F1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q1T7F1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q1T7F1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q1T7F1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q1T7F1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q1T7F1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q1T7F1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q1T7F1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q1T7F1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q1T7F1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q1T7F1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q1T7F1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms