Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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