Protein–RNA interactions for Protein: Q16678

CYP1B1, Cytochrome P450 1B1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP1B1Q16678 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYP1B1Q16678 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYP1B1Q16678 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CYP1B1Q16678 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP1B1Q16678 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP1B1Q16678 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP1B1Q16678 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP1B1Q16678 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP1B1Q16678 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP1B1Q16678 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP1B1Q16678 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP1B1Q16678 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP1B1Q16678 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP1B1Q16678 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP1B1Q16678 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CYP1B1Q16678 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP1B1Q16678 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP1B1Q16678 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP1B1Q16678 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP1B1Q16678 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP1B1Q16678 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP1B1Q16678 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP1B1Q16678 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP1B1Q16678 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP1B1Q16678 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP1B1Q16678 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP1B1Q16678 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP1B1Q16678 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP1B1Q16678 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP1B1Q16678 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP1B1Q16678 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP1B1Q16678 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP1B1Q16678 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP1B1Q16678 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP1B1Q16678 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP1B1Q16678 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP1B1Q16678 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP1B1Q16678 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP1B1Q16678 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP1B1Q16678 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP1B1Q16678 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP1B1Q16678 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP1B1Q16678 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP1B1Q16678 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms