Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STX1AQ16623 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
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