Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRIP10Q15642 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIP10Q15642 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIP10Q15642 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIP10Q15642 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIP10Q15642 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIP10Q15642 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIP10Q15642 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIP10Q15642 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIP10Q15642 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIP10Q15642 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIP10Q15642 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIP10Q15642 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIP10Q15642 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIP10Q15642 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIP10Q15642 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIP10Q15642 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIP10Q15642 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIP10Q15642 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIP10Q15642 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIP10Q15642 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIP10Q15642 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIP10Q15642 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIP10Q15642 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIP10Q15642 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIP10Q15642 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIP10Q15642 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIP10Q15642 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIP10Q15642 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIP10Q15642 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIP10Q15642 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIP10Q15642 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIP10Q15642 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIP10Q15642 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIP10Q15642 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIP10Q15642 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIP10Q15642 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIP10Q15642 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIP10Q15642 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIP10Q15642 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIP10Q15642 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIP10Q15642 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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