Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IRF4Q15306 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF4Q15306 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
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