Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDGFRLQ15198 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDGFRLQ15198 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFRLQ15198 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFRLQ15198 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFRLQ15198 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFRLQ15198 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFRLQ15198 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFRLQ15198 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFRLQ15198 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFRLQ15198 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFRLQ15198 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDGFRLQ15198 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDGFRLQ15198 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDGFRLQ15198 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDGFRLQ15198 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDGFRLQ15198 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PDGFRLQ15198 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDGFRLQ15198 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDGFRLQ15198 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDGFRLQ15198 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDGFRLQ15198 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDGFRLQ15198 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDGFRLQ15198 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDGFRLQ15198 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDGFRLQ15198 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDGFRLQ15198 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDGFRLQ15198 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDGFRLQ15198 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDGFRLQ15198 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDGFRLQ15198 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PDGFRLQ15198 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDGFRLQ15198 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDGFRLQ15198 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDGFRLQ15198 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDGFRLQ15198 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDGFRLQ15198 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDGFRLQ15198 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDGFRLQ15198 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDGFRLQ15198 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDGFRLQ15198 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDGFRLQ15198 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDGFRLQ15198 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDGFRLQ15198 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDGFRLQ15198 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDGFRLQ15198 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDGFRLQ15198 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDGFRLQ15198 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDGFRLQ15198 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDGFRLQ15198 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDGFRLQ15198 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDGFRLQ15198 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDGFRLQ15198 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDGFRLQ15198 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDGFRLQ15198 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDGFRLQ15198 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDGFRLQ15198 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDGFRLQ15198 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PDGFRLQ15198 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDGFRLQ15198 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDGFRLQ15198 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDGFRLQ15198 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDGFRLQ15198 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDGFRLQ15198 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDGFRLQ15198 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PDGFRLQ15198 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDGFRLQ15198 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDGFRLQ15198 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDGFRLQ15198 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDGFRLQ15198 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDGFRLQ15198 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDGFRLQ15198 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDGFRLQ15198 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
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