Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSMD6Q15008 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD6Q15008 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
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